ابن تیمیہ کو کئی بار مختلف حکام نے جیل میں ڈالنے کے واقعات ملتے ہیں کیونکہ وہ اپنی سخت اور بعض اوقات متنازعہ نظریات کی وجہ سے مختلف حکومتی اور دینی حلقوں کے ساتھ تنازعات میں رہتے تھے۔
لیکن سب سے مشہور واقعہ جو اکثر ذکر ہوتا ہے، وہ سلطنت مملوک مصر میں ہے۔ سلطان الناصر محمد بن قلاوون کے دور حکومت میں ابن تیمیہ کو ان کی عقائد اور فتووں کی وجہ سے گرفتار کر کے قید میں رکھا گیا تھا۔ ان پر مختلف الزامات لگائے گئے، جیسے کہ بدعتیں پھیلانا یا حکومتی اور مذہبی نظام کے خلاف فتوی دینا۔
ابن تیمیہ کو پہلی بار تقریباً 1306ء میں گرفتار کیا گیا تھا، اور مختلف اوقات میں جیل میں رکھا گیا اور پھر رہا کیا گیا۔ ان کی جیل جانے کی وجہ ان کے سخت علمی موقف اور بعض فتاویٰ تھے جو اُس وقت کے مذہبی اور سیاسی حکام کو ناگوار گزرے۔